Недавно появившийся редактор праймеров (PE) может производить все типы замены, вставки и удаления оснований, что значительно расширяет возможности редактирования генома. Однако повышение эффективности и точности редактирования с помощью PE представляет собой серьезную проблему. Здесь мы сообщаем о подходе, названном homologous 3' extension mediated prime editor (HOPE). HOPE использует парные prime editing guide RNAs (pegRNAs), кодирующие одинаковые исправления в смысловой и антисмысловой нитях ДНК, для достижения высокой эффективности редактирования в клетках эмбриональной почки человека 293T, а также в клетках колоректальной карциномы 116 с дефицитом репарации несоответствия. Кроме того, мы обнаружили, что HOPE демонстрирует значительно улучшенную чистоту продукта по сравнению с оригинальной системой PE3. Мы предполагаем, что этот усовершенствованный инструмент может расширить как фундаментальные исследования, так и терапевтическое применение редактирования праймеров.



Similar articles

High-efficiency prime editing with optimized, paired pegRNAs in plants. Lin Q, Jin S, Zong Y, Yu H, Zhu Z, Liu G, Kou L, Wang Y, Qiu JL, Li J, Gao C. Nat Biotechnol. 2021 Aug;39(8):923-927. doi: 10.1038/s41587-021-00868-w. Epub 2021 Mar 25. PMID: 33767395

Enhanced prime editing systems by manipulating cellular determinants of editing outcomes. Chen PJ, Hussmann JA, Yan J, Knipping F, Ravisankar P, Chen PF, Chen C, Nelson JW, Newby GA, Sahin M, Osborn MJ, Weissman JS, Adamson B, Liu DR. Cell. 2021 Oct 28;184(22):5635-5652.e29. doi: 10.1016/j.cell.2021.09.018. Epub 2021 Oct 14. PMID: 34653350 Free PMC article.

Engineered pegRNAs improve prime editing efficiency. Nelson JW, Randolph PB, Shen SP, Everette KA, Chen PJ, Anzalone AV, An M, Newby GA, Chen JC, Hsu A, Liu DR. Nat Biotechnol. 2022 Mar;40(3):402-410. doi: 10.1038/s41587-021-01039-7. Epub 2021 Oct 4. PMID: 34608327 Free PMC article.

Predicting the efficiency of prime editing guide RNAs in human cells. Kim HK, Yu G, Park J, Min S, Lee S, Yoon S, Kim HH. Nat Biotechnol. 2021 Feb;39(2):198-206. doi: 10.1038/s41587-020-0677-y. Epub 2020 Sep 21. PMID: 32958957

CRISPR base editing and prime editing: DSB and template-free editing systems for bacteria and plants. Abdullah, Jiang Z, Hong X, Zhang S, Yao R, Xiao Y. Synth Syst Biotechnol. 2020 Sep 2;5(4):277-292. doi: 10.1016/j.synbio.2020.08.003. eCollection 2020 Dec. PMID: 32954022 Free PMC article. Review.